Durant la période Kamakura, dans la région de Nara et d'Heian, les fermes sont plus complexes, avec des toits de chaumes et un plancher bois. Mais la cuisine reste en terre battue. Le niveau social modifie considérablement l'intérieur de l'habitat, mais les principes de structure et d'espace demeurent les mêmes.

A la période Yayoi, la partie enterrée est carrée. Quatre piliers servent de structure porteuse à la couverture. Ce peuple pratiquait la culture du riz et les seules constructions surélevées étaient les greniers. Ils connaissaient et travaillaient le bronze et le fer.

Peu à peu les constructions semis-enterrées disparurent pour des raisons d'humidité et de crues de rivières. Nous avons une meilleur connaissance de leur habitat par des objets en bronze les représentant. Peu à peu l'habitat évolue pour être au niveau du sol et d'une plus grande superficie.  

Certaines constructions utilisent encore aujourd'hui un type de couverture semblable, comme le village d'Ohara au Nord de Kyoto, ou encore des fermes vues au Nord Est de l'île de Shikoku (grande île de la Mer Intérieure).

Il reste de nombreuses incertitudes et inconnues surtout pour la transition de ce type d'habitat vers l'habitat a structure plus élaboré. Il est fort probable qu'il fut amené par les moines ou les nobles.

Quelques informations apparaissent vers l'ère Heian. Les maisons ordinaires ont le toit en lamelles de bois ou en planche ou encore en chaume (en partie centrale, ceinturée d'un auvent en bois). Certaines habitations ont le toit fait de longues planches de bois se prolongeant depuis l'arête du toit, jusqu'à servir d'auvent. Elles sont recouvertes de pièces de bois horizontales, maintenues avec des pierres.

Il est possible d'analyser l'évolution architecturale japonais en suivant les grande période historique de la construction du Japon.

Les grandes période historique de l'histoire japonaise.