1192 Les Minamoto établissent leur bafuku (siège militaire) a Kamakura. Minamoto no Yoritomo est nommé shôgun (littéralement général en chef des armées) par l'empereur qui conserve son titre et une influence morale.
1199 à 1221 sont des années d'instabilités politiques.
1229 introduction, en provenance de chine, du bouddhisme zen (nom chinois: Chan).
1232 rédaction du Jôei Shikimoku charte en 51 article stipulant les droits et devoirs de chacun selon son rang. Cette charte sera amendé en 1243 et 1286.
1274 et 1281 attaques avortés de la chine des mongols. Le Japon doit son salue à la conjonction de plusieurs facteurs: inexpérience de la flotte mongol, inadéquation d'une partie de la flotte à la haute mer (utilisation de bateaux fluviaux), au défaut de construction (moins d'un an pour construire et réunir une flotte de 4 400 navires). Ces attaques ont néanmoins eu pour conséquences d'appauvrir le pouvoir en place et la caste des bushi. Cela aboutissant plus ou moins directement en 1333 au renversement du pouvoir du bafuku par l'empereur Go-Daigo avec l'appui d'Ashikaga Takauji.